上一篇著作先容了对于MRD的基本观点、分析战略和检测时辰点，确定见（MRD（分子残留病灶）知几许？咱们为什么需要善良它（上））。

本文将陆续对MRD的临床道理、检测难点进行申诉。

一、临床道理

当今，MRD在实体瘤当中应用的临床道理主要蚁合在：预后分层、复发监测、疗效评估、药物假期等，其他应用场景还包括临床考试替代极端、基于新扶持疗养反映的手术方案以及临床考试受试者入组筛选。

01.预后分层

MRD在实体瘤当中预后价值计议的较为充分的包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌、膀胱癌等。吴一龙讲授“肺癌三部曲”中第一部的计议入组261名患者，中位随访时辰19.7个月。当整合纵向时辰点时NPV和PPV鉴别增多到96.8%和89.1%。换句话说，在纵向检测不到MRD的患者中，有96.8%的患者在终末一次随访时仍然处于无病状况(其中70.1%处于I期，17.4%处于Ⅱ期，12.5%处于III期)。纵向时辰点检测不到MRD患者与调整东说念主群相对应，何况不受临床分期的影响[1]。教导在18个月内纵向检测不到MRD的患者可能是调整东说念主群。

在本年刚发布的一项针对156名原发性乳腺癌患者在手术和扶持化疗后采纳长达12年的临床监测。半年收罗一次的血液样本，在34名复发的患者中，有30东说念主的ctDNA在临床或发射学复发之前被检测到。复发预计的时辰隔断最长可达38个月(中位数为10.5个月)，ctDNA阳性与无复发生涯期和总生涯期较短相关。戒指同样教导术后一语气ctDNA评估具有强劲的预后价值，为早期疗养干豫提供了一个潜在的窗口，何况可能比当今的临床常用形式(如癌抗原)更灵验[2]。

个性化ctDNA检测在一语气血浆样本中预计无复发生涯率和总生涯率[2]

02.复发监测

LUNGCA-1计议纳入了330名I-III期NSCLC患者，鉴别于三个围手术期时辰点(术前、术后3天和1个月)检测。戒指证实，MRD阳性(术后3天和/或1个月的ctDNA阳性)是疾病复发的强预计因子。基于ctDNA的MRD对RFS预计的相对孝敬高于系数临床病理变量，举例TNM分期。此外，采纳扶持疗养的MRD阳性患者比未采纳扶持疗养的MRD阳性患者RFS有所改善，而采纳扶持疗养的MRD阴性患者的RFS反而低于未采纳扶持疗养的MRD阴性患者。计议教导围手术期ctDNA分析可灵验早期发现MRD和非小细胞肺癌复发风险分层，有意于非小细胞癌患者的科罚[3]。

围手术期ctDNA对非小细胞肺癌患者预后的影响[3]

在临床方案中使用ctDNA的实用性建议指出，术后ctDNA-MRD检测阳性的患者，复发风险近乎100%[4]。

预后好的患者往往复发风险低，预后不好的患者往往复发风险高，这两方面齐是高度谐和的。对于预后和复发的监测单个时辰点的MRD状况预计价值有限，应不雅察遥远戒指。

03.疗效监测

MRD对疗养戒指的预计评估引出了另一个观点：适合性疗养。其界说为“阁下生物标记物精确弃取患者，在圭臬疗养的基础上实行降阶大要升阶疗养，以期得到更佳的疗效、更高的生活质地和/或更好的资本效益”。ctDNA-MRD看成适合性疗养的标记物，当今根据复旧阳性用于疏通升阶疗养，阴性用于降阶疗养melody marks 肛交，但需要更多的临床考试证据[1]。一项计议露馅III期不成切除NSCLC患者采纳放化疗后，MRD捏续阴性者2年DFS可达88.4%，达到了潜在调整。同期，CRT早期达到MRD阴性患者预后较好，采纳/不采纳免疫自如疗养预后很是，教导了MRD在局部晚期NSCLC疗养中潜在减疗养疏通价值[5]。

当今计议露馅，在ctDNA-MRD弥散准确，阴性预计值跳跃90%的前提下，临床和科研责任者不错依据ctDNA-MRD检测戒指将患者分为调整东说念主群（ctDNA-MRD阴性）和高危东说念主群（ctDNA-MRD阳性）。对于调整东说念主群，不错接洽住手疗养，仅进行密切监测；对于高危东说念主群，则需要在圭臬疗养的基础上，进行结伴疗养大要强化疗养。这一论断已在多个计议中被反复证实[6]。

04.药物假期

上文提到的适合性疗养当今临床可能更善良的是降阶疗养。在本年发布的“肺癌三部曲”的第三部计议证明注解了药物假期在肺癌规模应用的可行性。计议入组60名经TKI和LCT疗养后未复发的晚期NSCLC患者，经过前期疗养（手术/放疗）后，经PET证据达到影像学CR状况，同期CEA（癌胚抗原）/血液ctDNA-MRD达到阴性并住手靶向药物，投入“药物假期”，此阶段开动需依期复查（影像学+CEA+ctDNA），出现任一查验的阳性戒指，则从头用药。戒指露馅，A组（捏续监测无很是，仍在停药状况）患者的PFS率高达100%，这类患者约占13%；B组（严实监测下出现血液标记物CEA/ctDNA阳性而从头用药）患者的中位PFS达到20.2个月，迥殊了第三代EGFR-TKI在一线疗养时的中位PFS，这类患者约占50%多；C组（患者停药阶段出现影像学的疾病发扬，从头用药）患者的中位PFS为5.5个月。戒指标明，弃取适合性降阶疗养战略不错让70%以上的患者获益，且推迟耐药时辰，蔓延靶向用药的灵验区间，中位“药物假期”的时长可达9.1个月，何况患者再次出现MRD阳性后，对于靶向药物仍然明锐，总体患者的中位PFS为18.4个月[7]。

《非小细胞肺癌适合性疗养中国内行共鸣》提到：EGFR突变IV期非小细胞肺癌经过系统和局部疗养后，影像学无可见或无代谢肿瘤病灶时，可接洽药物假期，需在生物标记物疏通下实行适合性疗养[8]。

跟着诊疗技巧的发展，许多癌症已成为慢性病，越来越多的患者处于“带瘤生涯”的状况，在治病的同期也要保证生活质地。这就对患者的定时监测、药物使用和疗养方案提议了更高的条目，正确纠合和使用MRD不错为肿瘤患者带来深广收益。

除上述道理外，MRD动态监测还有望将临床考试极端提前，镌汰临床考试时辰，抵制药物研发的资本，同期有助于肿瘤药物快速上市或加快已上市药物的适合症拓展。检测血液ctDNA水平是一种在抗癌疗养时间监测肿瘤反映和基因变异变化的无创性形式，何况不错看成生物标记物来扶持实体瘤药物开发。连年来，FDA还是批准了几项基于ctDNA的扶持会诊考试，使安全灵验的靶向疗养成为可能[9]。制药企业可阁下所试药物疗养后MRD的转阴看成依据为患者分层，从而有助于制药企业更好地证明注解药物疗效，耕种药物上市奏遵循[10]。

二、检测难点

正如上文所说，当今MRD检测中最受善良的是其检测明锐性问题，其阴性预计值能否达到90%以上，此问题又可拆分为突变个性化保证、测序深度高和灵验深度的均衡及降噪算法。

01.突变个性化保证

肿瘤患者突变具有个性化性格，每个肿瘤患者的突变谱具有较高的分子异质性，同期患者个体中仅捎带相称少许相通的基因突变。

02.测序深度高和灵验深度的均衡

早中期实体瘤患者开释到外周血中的ctDNA含量一般较少，ctDNA含量一般低于1%，需要较高的测序深度，但也存在灵验深度饱和的瓶颈。弃取NGS检测形式的基本本事圭臬是可踏实检出品貌≥0.02％的ctDNA。

03.降噪算法

降噪条目高，单纯地增多测序数据量和深度会带来严重的配景杂音和克隆性造血突变检出等问题，可能导致MRD戒指的假阴性或假阳性，降噪算法是MRD检测的要道本事。

从硬件开采方面，对测序仪通量条目高，需要匹配中高通量的测序仪来进行测序；

从软件生信方面，若何遗弃测序造作及配景信号的干扰，从“超高妙度”的reads中识别出“个位数”的真实变异reads，这需要UMI分子标签、高性能的生信算法经过等本事加捏，更需要生信专科东说念主士对数据分析、报警戒指进行严格的审核，能力真的地将本事滚动为检测中的上风。

克隆造血(CHIP)或非肿瘤性造血干细胞的DNA片断可导致假阳性ctDNA戒指。不错通过先进的生物信息学分析或ctDNA测序与白细胞和/或匹配肿瘤组织的比拟来减少这些假阳性戒指[11]。因此，建议对白细胞进行额外的NGS分析，以遗弃芯片关连的变异，尤其是在MRD或早期癌症检测的情况下。落地MRD检测后，个体化定制panel在坐褥和使用门径齐应有严格的质地科罚纪律，举例每条探针的质控信息，每个位点的掩盖水对等等，严格的质控亦然为特出到更精确的检测戒指。Tumor-informed道路是基于原发肿瘤组织的变异信息，形成每个患者个性化的变异图谱并阁下其进行MRD监控。个性化panel战略考中每位患者肿瘤特异性的主克隆位点形成个性化基因变异图谱，愈加妥当肿瘤异质性特征，耕种MRD动态监测的精确性，能最大化地体现MRD动态监测才略。ctDNA检测时通过配对的白细胞样本，大要网络整合检测到的克隆性造血突变，构建克隆性造血突变配景库，可灵验匡助去除克隆性造血形成的假阳性[12]。

机灵度、特异性、克隆异质性、生信分析、阳性判读与答复解读同样是MRD的难点，均尚未有谐和圭臬亦未完了共鸣，仍处在探索阶段。面前之需是尽快树立对MRD检测居品质能的评价圭臬;开展前瞻性临床计议以匡助MRD检测过渡到圭臬临床施行;陆续积贮临床考试以及真实宇宙计议数据来优化、完善MRD检测本事/居品。

三、飞朔生物检测战略

飞朔生物自主研发的实体瘤分子残留病灶(MRD)检测居品分为定制化Panel检测战略和固定化Panel检测战略。定制化Panel先对原发肿瘤组织进行全面的全外显子测序，确定患者特异的基因突变戒指，然后定制个性化Panel对组织中的一定数目的突变位点进行后续的ctDNA检测。

固定化Panel是基于血浆ctDNA的固定panel检测。Panel更大，掩盖位点多，中高妙度测序(5万X)，可对耐药/得到性耐药监测及疗效评估，纳入肺癌、结直肠癌、胃癌和肝癌4个癌种194个基因CDS大要热门区域，驱动基因、靶向用药、免疫关连基因，补充高频突变的非驱动基因。检测范围更广，检测愈加机灵。

参考文件

[1] Cancer Discov 2022 Jul 6;12(7):1690-1701.

[2] JCO Precis Oncol 2024 Apr:8:e2300456.

[3] Clin Cancer Res 2022 Aug 2;28(15):3308-3317.

[4] Nature 2023 Jul;619(7969):259-268..

[5] Cell. 2023 Oct 9;41(10):1763-1773.e4.

[6] ctDNA-MRD疏通下的肺癌适合性疗养异日肺癌精确疗养标的

童颜巨乳

[7] JAMA Oncol 2024 Jul 1;10(7):932-940.

[8] 非小细胞肺癌适合性疗养中国内行共鸣

[9] CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol . 2024 May;13(5):691-709.

[10] MRD动态监测与癌症术后疗养战略篡改

[11] Front Genet. 2023 Aug 10:14:1172108.

[12] ctDNA高通量测序临床施行内行共鸣（2022年版）

声明：本文仅用于共享，如波及版权等问题melody marks 肛交，请尽快连络咱们，咱们第一时辰纠正，谢谢！

阴性阳性药物ctDNA患者发布于：福建省声明：该文不雅点仅代表作家本东说念主，搜狐号系信息发布平台，搜狐仅提供信息存储空间工作。